La carrière musicale de Joan est des plus impressionnantes.

Elle joua avec The Dambuilders, Those Bastard Souls (avec le guitariste de Grifters, David Shouse, Steven Drozd des Flaming Lips et Fred Armisen de Trenchmouth) et Black Beetle (avec Michael Tighe et Parker Kindred qui jouait dans le groupe de Jeff Buckley), avant de décider de jouer seule. Entre temps son ami Antony lui demanda de rejoindre les Johnsons et elle joua avec eux pendant plusieurs années, jusqu’à ce que Rufus Wainwright la demande dans son groupe.